Міська дитяча лікарня № 5 заснована у 1990 році, і є однією з потужних лікарень міста Запоріжжя та Запорізької області. З моменту відкриття лікарнею керували: Лахно Володимир Гаврилович, Бабанська Надія Анатоліївна, Токар Олена Іванівна, Запорожченко Андрій Григорійович, Кулєш Ірина Олександрівна.

На теперішній час керівництво лікарні здійснює в.о. директора – медичний директор Шевченко Раїса Леонідівна.

КНП «Міська дитяча лікарня №5» ЗМР – це багатопрофільна лікарня інтенсивного лікування дитячого населення другого рівня надання медичної допомоги. На базі лікарні сконцентровано всі види надання спеціалізованої медичної допомоги дитячому населенню: стаціонарна, амбулаторно-поліклінічна (консультативна) та мобільна паліативна. 

В складі лікарні функціонує консультативно-діагностичний центр, який надає спеціалізовану медичну допомогу дітям м. Запоріжжя та стаціонар на 250 ліжок, в складі якого 9 відділень: відділення анестезіології, інтенсивної терапії та хронічного діалізу,  відділення хірургії та оперативної ендоскопії, отоларингологічне відділення, педіатричне відділення №1, педіатричне відділення №2, неврологічне відділення, інфекційне відділення дітей раннього віку, інфекційно-боксоване діагностичне відділення (у зв’язку з реконструкцією тимчасово закрите), відділення невідкладної (екстреної) медичної допомоги.

Відділення лікарні є навчальною базою для кафедр Запорізького державного медико-фармацевтичного університету.

Консультативно-діагностичний центр(далі – КДЦ): підрозділ №1 КДЦ, підрозділ № 2 КДЦ, підрозділ № 3 КДЦ, підрозділ № 4 КДЦ, центр діагностики та лікування алергологічних і соматичних захворювань.

Допоміжний та лікувально-діагностичний підрозділ: відділення функціональної діагностики, відділення фізичної та реабілітаційної медицини, рентгенологічне відділення, клініко-діагностична лабораторія з імунологічним відділом, централізована бактеріологічна лабораторія, травматологічний пункт, аптека, відділ інфекційного контролю.

Також, структура лікарні включає: адміністративно-управлінський підрозділ, економічно-бухгалтерський підрозділ та технічно-господарський підрозділ.